修改的主要內容包括五個方面：在取消行政審批事項方面，通過修改放射性藥品管理辦法等22部行政法規的68個條款，取消了放射性藥品經營審批等34項審批項目；在取消行政審批中介服務事項方面，通過修改地震安全性評價管理條例等2部行政法規的4個條款，取消、規范了建設工程場地地震安全性評價等2項行政審批中介服務。在取消職業資格事項方面，通過修改招標投標法實施條例等10部行政法規的27個條款，取消了招標師執業資格等10項職業資格。在企業投資項目核準前置審批改革方面，通過修改公共機構節能條例等5部行政法規的7個條款，將建設項目節能評估和審查等9項企業投資項目核準前置審批改為與項目核準并聯辦理。在加強后續監管方面，強化了有關部門對行政審批項目取消后從事相關活動的監管。
其中，《決定》明確，將《中華人民共和國招標投標法實施條例》第十二條修改為：“招標代理機構應當擁有一定數量的具備編制招標文件、組織評標等相應能力的專業人員。”刪去第七十八條：“取得招標職業資格的專業人員違反國家有關規定辦理招標業務的，責令改正，給予警告；情節嚴重的，暫停一定期限內從事招標業務；情節特別嚴重的，取消招標職業資格。”將《公共機構節能條例》第二十條第二款修改為：“國務院和縣級以上地方各級人民政府負責審批固定資產投資項目的部門，應當嚴格控制公共機構建設項目的建設規模和標準，統籌兼顧節能投資和效益，對建設項目進行節能評估和審查，未通過節能評估和審查的項目，不得開工建設；政府投資項目未通過節能評估和審查的，依法負責項目審批的部門不得批準建設。”刪去第三十九條第一款中的“或者核準”。
同時，廢止了城鄉集市貿易管理辦法、工資基金暫行管理辦法、國家體育鍛煉標準施行辦法3部行政法規。這3部行政法規有的是主要內容已被有關法律、行政法規替代；有的是規定的職責已經取消，有關內容已有新規定；有的是適應當時情況的具體規定，目前實際已不再適用。
